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1、仙人掌科有140个属，分别是：一、叶仙人掌亚科（Pereskioideae）包括如下各属：叶仙人掌属（木麒麟属，Pereskia Mill. ）、拟叶仙人掌属（Maihuenia Phil.）等。

2、二、仙人掌亚科（Opuntioideae）包括如下各属：顶花麒麟掌属（Quiabentia Britton et Rose）、麒麟掌属（Pereskiopsis Britton et Rose）、翅子掌属（Pterocactus K. Schum.）、长蕊掌属（Tacinga Britton et Rose）、仙人掌属（Opuntia Tourn. ex Mill.）等。

3、三、仙人柱亚科（Cereoideae）⑴仙人柱族（Cereeae）①仙人柱亚族（Cereinae）包括如下各属：蟹爪莲属(zygocactus truncatusBritton et Rose）、天轮柱属（Cereus Mill.）、残雪柱属（Monvillea Britton et Rose）、翁柱属（Cephalocereus Pfeiff.）、麝香柱属（Jasminocereus Britton et Rose）、近卫柱属（Stetsonia Britton et Rose）、群蛇柱属（Browningia Britton et Rose）、角鳞柱属（Escontria Rose）、巨人柱属（Carnegiea Britton et Rose）、摩天柱属（Pachycereus Britton et Rose）、鸡冠柱属（Lophocereus Britton et Rose）、龙神柱属（Myrtillocactus Console）、群戟柱属（Lemaireocereus Britton et Rose）、恐龙角属（Corryocactus Britton et Rose）、壶花柱属（Eulychnia Phil.）、大织冠属（Neoraimondia Britton et Rose）、鹿角柱属（Echinocereus Engelm.）、薮蛇柱属（Rathbunia Britton et Rose）、乔木柱属（Neoabbottia Britton et Rose）、花铠柱属（Armatocereus Backeb.）、细阁柱属（Leptocereus Britton et Rose）、飞龙柱属（Brachycereus Britton et Rose）、灌木柱属（Calymmanthium F. Ritter）、树木柱属（Dendrocereus Britton et Rose）、有刺萼柱属（Acanthocereus Britton et Rose）、卧龙柱属（Harrisia Britton ）、块根柱属（Peniocereus Britton et Rose）、仙人杖属（Nyctocereus Britton et Rose）等。

4、②量天尺亚族（Hylocereinae）包括如下各属：量天尺属（Hylocereus Britton et Rose）、蛇鞭柱属（Selenicereus Britton et Rose）、牡丹柱属（Heliocereus Britton et Rose）、瘤果仙人鞭属（Weberocereus Britton et Rose）、鼠尾掌属（Aporocactus Lem.）、昙花属（Epiphyllum Haw. ）、令箭荷花属（Nopalxochia Britton et Rose）、姬孔雀属（Disocactus Lindl.）、仙人指属（Schlumbergera Lem.）、蟹爪属（Zygocactus K. Schum.）、假昙花属（Rhipsalidopsis Britton et Rose）、丝苇属（Rhipsalis Gaertn.）等。

5、③老乐柱亚族（Espostoinae）包括如下各属：老乐柱属（Espostoa Britton et Rose）、刺蔓柱属（Leocereus Britton et Rose）、刺翁柱属（Oreocereus Riccob.）、花冠柱属（Borzicactus Riccobono）、白仙玉属（Matucana Britton et Rose）、管花柱属（Cleistocactus Lem.）、绯筒球属（Denmoza Britton et Rose）、小花柱属（Zehntnerella Britton et Rose）、髯玉属（Oroya Britton et Rose）、毛花柱属（Trichocereus Riccob.）、仙人球属（Echinopsis Zucc.）、关节柱属（Arthrocereus A. Berger）、丽花球属（Lobivia Britton et Rose）、子孙球属（Rebutia K. Schum.）、白檀属（Chamaecereus Britton et Rose）、小槌球属（Mila）等。

6、⑵仙人球族（Cacteae）①极光球亚族（Eriosycinae）包括如下各属：极光球属（Eriosyce Phil. ）智利球属（Neoporteria Britton et Rose）、南国玉属（Notocactus A. Berger ）、士童属（Frailea Britton et Rose）、狼爪玉属（Austrocactus Britton et Rose）、锦绣玉属（Parodia Speg. ）、松露玉属（Blossfeldia Werderm.）等。

7、②花座球亚族（Melocactinae）包括如下各属：花座球属（Melocactus Boehm.）、圆盘玉属（Discocactus Pfeiff.）等。

8、③金琥亚族（Echinocactinae）包括如下各属：金琥属（Echinocactus Link et Otto）、星球属（Astrophytum Lem.）、绫波属（Homalocephala Britton et Rose）、龙爪球属（Copiapoa Britton et Rose）、裸萼球属（Gymnocalycium Pfeiff.）、帝冠属（Obregonia denegrii）、月华玉属（Pediocactus Britton et Rose）、瘤玉属（Thelocactus Britton et Rose）、强刺球属（Ferocactus Britton et Rose）、长钩球属（Hamatocactus Britton et Rose）、多棱球属（Echinofossulocactus Lawrence）、光山属（Leuchtenbergia Hook.）、皱棱属（Aztekium Boed.）、乌羽玉属（Lophophora Coult.）、岩牡丹属（Ariocarpus Scheidw.）、月世界属（Epithelantha F. A. C. Weber）、菊水属（Strombocactus Britton et Rose）、裸玉属（Neolloydia Britton et Rose）、菠萝球属（顶花球属，Coryphantha Lem.）、斧突球属（Pelecyphora Ehrenb.）、松球玉属（Encephalocarpus A. Berger）、松球属（Escobaria Britton et Rose）、长疣球属（Dolichothele Britton et Rose）、乳突球属（Mammillaria Haw.）等。

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